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工程预算由于工程建设涉及面广和其本身所具有的复杂性，在其建设过程中，不可避免地发生设计变更、材料设备变更等多种引起工程预算变化的情况。对于采取中标价从签证作为结算方式的工程，更应注意增减费用的审查。应注意设计变更的审查。设计变更单是设计单位在施工中发现需要变更的部位，或是由于建设单位需要改变使用功能、装修标准等而发出的变更通知单。它应是由设计单位、建设单位、施工单位、监理单位协商后共用签署的。审查设计变更时，一要应查验手续是否完备；二要判定该项变更是否引起经济利益上的增减变动，因为有的变更只是技术变更，并不引起经济变更。还要注意查阅竣工图，因为对于工程量增加而引起费用增加的项目。
工程预算按签证性质可以分为：
①工程经济签证：是指在施工过程中由于场地、环境、业主要求、合同缺陷、违约、设计变更或施工图错误等，造成业主或承包商经济损失方面的签证。经济签证涉及面广，项目繁多复杂，应严格控制签证范围和内容，把握好有关定额、文件规定。建筑工程质量检收划分为检验批、分项工程、分部工程、单位工程的质量验收，做出程序和组织规定要求：（1）检验批的质量验收记录由施工项目专业质量检查员填写，监理工程师（建设单位项目专业技术负责人）组织项目专业质量检查员等进行验收。（2）分项工程质量应由监理工程师（建设单位项目专业技术负责人）组织项目专业技木负责人等进行验收。
工程设计是根据项目用途要求采用科学先进的方法，完整地表现建设物的外型、空间布置、结构以及群体的组成、与周围环境的相互关系等，是对昌都工程预算进行规划的过程，它对昌都工程预算项目的造价和使用后所产生的社会经济效益起决定性的作用。设计阶段的工作主要包括设计单位的选择、设计方案的确定、总平面设计、建筑结构设计、材料设备的选用等。审计时，一是要了解设计单位和设计人员是否挂靠专业设计部门，是否是专业设计人员，有无设计资格许可证。因为有些社会上的非专业设计人员由于怕负责任、图省事，使用不规范图纸设计，随意加大工程系数、增大结构截面尺寸、提高水泥标号，从而增加了工程预算造价。二是要求设计部门积极推行投资规模限额设计，使之贯穿于设计的全过程，严格控制各项经济指标，防止“设计不算账、概算见分晓”的被动局面出现。三是审核总平面设计对土地利用、工程管网长度的控制是否合理；建筑结构的设计是否符合规范要求；装修设计是否超标；选用的建筑材料是否符合市场供求关系，新型建筑材料是否科学经济；选用的设备是否先进，型号、数量是否符合规定要求，来源、价格是否合理。昌都工程预算招投标工作是建设单位择优选择施工、物资设备供应等承包单位的主要方式，是市场经济调节下昌都工程预算管理体制的一项重要内容，它改变了过去单一的依靠行政手段分配施工任务的做法，解决了好坏不分，赏罚不明的问题，达到了工期短、质量优、造价低、效益高的目的。然而，由于市场机制还不够健全，工程招投标工作还存在一些问题，如招投标方式和程序不符合规定，建设单位个别管理人员与投标单位暗中勾结、弄虚作假，使招投标工作失去了实际意义。因此，审计部门应与工程招投标管理部门协作，加强对招投标工作的审计监督和检查。
承包工程合同签定不规范，工程结算计价难以确定。工程预算在审计过程中发现，建设、施工双方承包工程合同签订不规范。在签订合同时不按投标文件的内容逐一填写，尤其是建筑规模和中标价，存在少填或者不填的现象，给工程计价取费留下活口，目的是为了竣工后高报工程结算价格打下伏笔，使得原本十分严肃的合同失去约束作用，建设单位失去了对施工单位工程报价的有效监督，容易造成决算价格偏高。同时，给工程结算造价审核带来难度和风险。
