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工程预算审计主要针对工程项目决算的，在一个建设项目竣工完成，建设单位与施工单位结算工程款时进行的。工程预算审计就是工程预算审核（审价），是工程预算咨询单位咨询业务的一部分。受业主委托对其工程项目的概算、预算及结算等，依据现行 政策法规、计价依据及相关工程技术资料对送审造价的工程量、单价及取费等进行逐项审核。在运用工程量清单计价模式进行工程预算审计工作时，可以从以下几个方面来进行：
工程预算工作内容：
1.认真对照商务标清单，把全部清单工程量全部自己计算一遍，看看是否有误差
2.认真对照商务标清单，把清单综合单价和主材价与市场询价做好对比，然后分析
3.进行分包时，要做法严格控制分包单位的清单工程量及价格
4.积极到现场去观察，做好图纸会审的工作，提出有利我方的变更签证
5.相关工程进度款格式、月报格式、工程联系单格式、现场经济签证格式等要从监理及甲方要取。
6.工程联系单、现场经济签证单及索赔的编制切记要理由充分，论点鲜明，证据齐全，把原因全归结于甲方、监理、设计院及其它因素，加大事情严重性及我方损失性，工程量适当加大。
工程预算随着我国经济的迅速发展 加强了基本建设力度在取得巨大成就的同时也出现了一些值得重视的问题。如某些施工单位为了追求自身的利益，在基建工程上营私舞弊，频频出现高估冒算的现象。根据以往工作经验，进行工程决算审计常发现的问题有：多列工程项目、工程量不实、高套定额、乱取费用等问题。为了管理好并合理使用基建资金提高投资效益和维护建设方利益加强基建工程决算的审计工作非常重要。开展工程决算审计主要从以下几个方面入手。
积极采用招投标的方法选择设计单位，在合同中明确要求设计人员对投资问题的重视，比如，在合同中可以规定，如果乐山工程预算设计变更费用超出施工合同价的5%，就要扣除一定比例的设计费用。优化设计方案，控制工程造价。为了控制工程造价，设计人员要多拿出几套设计方案由造价人员分析，造价人员要对其中涉及的影响因素从经济角度进行深入分析，以实现投资小化。比如某市政排水管线工程，原拟定新建691m长的D1800管道，其中30m需要进行顶管施工。后来，经过实际勘察，决定改变原有的设计方案，将D1800管道的长度缩减为558m，且不需要顶管施工，终节省工程费用近100万元[。改变收费方法。在收取设计费用方面，要积极引入限额按比例提成的方法，促使设计单位与建设单位一同成本控制意识，进而实现成本控制目标。在施工阶段，对工程造价产生影响的因素会比较少，但是乐山工程预算由于该阶段是工程实体形成的关键阶段，如果控制不好，也会使得造价难以得到控制施工现场管理混乱。业主方缺乏一套系统完整的管理体系，各部门之间、各人员之间职责不清，协调不力。施工方造价文件保管不清、不全，在竣工结算时出现种种矛盾，使得工程造价失控。
