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碳源 现代研究认为碳氮比小于10，异养细菌优先利用有机氮，养殖水体氨氮增加，如果碳氮比大于10异养细菌可同时利用有机氮和无机氮，消耗铵态氮。异养细菌数量的增加，有利于形成生物絮团，其中包括细菌，藻类，有机物，原生动物，浮游动物等。在适合的碳氮比及溶解氧情况下，不需要额外添加异养细菌，细菌就会自行繁殖生长，达到控制水体环境的目的。一般认为水产养殖中合适的碳氮比水平在10-15:1，越是使用饲料蛋白高的饲料，水体中也就越缺乏碳源，所以适时适量补充碳源尤为重要。
碳源 碳氢化合物 石油产品可以作为某些微生物发酵的碳源。石油产品在单细胞蛋白、氨基酸、核昔酸、有机酸、维生素、酶类、糖类、抗生素等发酵中均有研究。由于成本、市场、安全性等因素投入工业化生产的很少。随着石油资源的减少和环境问题的日趋严重，可以预期围绕碳氢化合物的生物利用、转化、降解等相关研究会受到更多的重视。 复合碳源作为一种新型的生物碳源，可以促进水处理的反硝化脱氮效果、增强异样菌群的繁殖能力，很大程度上提高了污水氮去除效果。复合碳源的生物利用率高，可以让异样菌群快速繁殖，加快了污水处理效率。
